由于總面積是一定的，而許多第三方物流企業(yè)在建造自動(dòng)化立體倉庫時(shí)只重視辦公、實(shí)驗(包括研發(fā))的面積，卻忽視了庫房面積，因此造成了這種局面，即為了滿(mǎn)足庫容量的需要，只好通過(guò)向空間發(fā)展來(lái)達到要求。但是貨架越高，機械設備的采購成本和運行成本也就越高。除此之外，由于自動(dòng)化立體倉庫內優(yōu)的物流路線(xiàn)是直線(xiàn)形的，但在倉庫設計時(shí)往往會(huì )受到平面面積的限制，造成本身物流路線(xiàn)的迂回(往往是s形，甚至是網(wǎng)狀)，這會(huì )增加許多不必要的投入和麻煩。

不管自動(dòng)化立體倉庫的自動(dòng)化程度有多高，具體運作時(shí)仍需要一定的人工勞動(dòng)，因此工作人員的數量要合適。人員不足會(huì )降低倉庫的效率，太多又會(huì )造成浪費。自動(dòng)化立體倉庫采用了大量的設備，因此對人員的素質(zhì)要求比較高，人員素質(zhì)跟不上，同樣會(huì )降低倉庫的吞吐能力。第三方物流企業(yè)需要招聘的人才，并對其進(jìn)行的培訓。

自動(dòng)化立體倉庫的上游、下游及其內部各子系統的協(xié)調，有一個(gè)木桶效應的問(wèn)題，即短的那一塊木板決定了木桶的容量。有的倉庫采用了很多的高科技產(chǎn)品，各種設施設備也非常，但是由于各子系統間協(xié)調性、兼容性不好，造成整體運作能力比預期差很多。

提高空間利用率
早期立體倉庫的構想，其基本出發(fā)點(diǎn)就是提高空間利用率，充分節約有限且寶貴的土地。在西方有些發(fā)達國家，提高空間利用率的觀(guān)點(diǎn)已有更廣泛深刻的含義，節約土地，已與節約能源、環(huán)境保護等更多的方面聯(lián)系起來(lái)。有些甚至把空間的利用率作為系統合理性和性考核的重要指標來(lái)對待。
立體庫的空間利用率與其規劃緊密相連。一般來(lái)說(shuō)，自動(dòng)化高架倉庫其空間利用率為普通平庫的2-5倍。這是相當可觀(guān)的。

確定自動(dòng)化立體倉庫的主要形式及相關(guān)參數
所有原始資料收集完畢后，可根據這些手資料計算出設計時(shí)所需的相關(guān)參數，包括：①對整個(gè)庫區的出入庫總量要求，亦即倉庫的流量要求：②貨物單元的外形尺寸及其重量；⑤倉庫儲存區（貨架區）的倉位數量：④結合上述三點(diǎn)確定儲存區（貨架廠(chǎng)）貨架的排數、列數及巷道數目其它相關(guān)技術(shù)參數。
自動(dòng)化立體倉庫可以形成的生產(chǎn)鏈，促進(jìn)了生產(chǎn)力的進(jìn)步。人士指出，由于自動(dòng)化立體倉庫的存取，因此可以有效地連接倉庫外地生產(chǎn)環(huán)節，可以在存儲中形成自動(dòng)化的物流系統，從而形成有計劃有編排的生產(chǎn)鏈，使生產(chǎn)能力得到了大幅度的提升。