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雖然有機肥的成分種類(lèi)較多，但是每種養分的含量相對較少，并且病菌較多。需要存放腐熟以殺滅病菌、并與化學(xué)肥料配合使用，效果更好。
隨著(zhù)科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展，通過(guò)有益菌群的人工篩選、分離、馴化培養技術(shù)，將有益菌群接入無(wú)害化處理后有機肥中，可以生產(chǎn)出多種多樣不同品種的生物有機肥，它能改善土質(zhì)、減少環(huán)境污染、增肥增效等。
有機農業(yè)中使用的有機肥需經(jīng)過(guò)有機認證機構的認證，符合產(chǎn)品的生產(chǎn)標準。近些年來(lái)，我國各種生物肥料發(fā)展迅速，年產(chǎn)量達數十萬(wàn)噸以上。這些生物肥料以科技含量較高、增產(chǎn)效果明顯和為主要特點(diǎn)，它的生產(chǎn)、推廣和應用對增進(jìn)土壤肥力，提高農作物產(chǎn)量，改善農作物品質(zhì)和切實(shí)推行農業(yè)可持續發(fā)展都有積極意義。 針對生物肥料在生產(chǎn)、產(chǎn)品質(zhì)量和使用等方面存在的問(wèn)題，本刊記者采訪(fǎng)了江西農業(yè)大學(xué)高勇生教授，旨在提高農村廣大群眾對這類(lèi)肥料的認識，更加正確、科學(xué)地使用這些肥料，以促進(jìn)我國生物肥料的健康發(fā)展。

生物有機肥是指特定功用微生物與主要以動(dòng)植物殘體(如畜禽糞便、農作物秸稈等)為來(lái)歷并經(jīng)無(wú)害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類(lèi)兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。和化肥比較，生物有機肥營(yíng)養元素完全，具有改善土壤、進(jìn)步產(chǎn)品品質(zhì)、改善作物根際微生物群、進(jìn)步植物的抗病蟲(chóng)才能、進(jìn)步化肥使用率等特色，深受農喜歡?？墒?，在近年來(lái)生物有機肥出產(chǎn)經(jīng)銷(xiāo)和實(shí)踐使用中，卻呈現了一系列亟待解決的問(wèn)題，詳細如下：

堆肥：各類(lèi)桔稈、落葉、青草、動(dòng)植物殘體、人畜糞便為原料，按比例相互混合或與少量泥土混合進(jìn)行好氧發(fā)酵腐熟而成的一種肥料。
漚肥：漚肥所用原料與堆肥基本相同，只是在淹水條件下進(jìn)行發(fā)酵而成.
廄肥：指豬、牛、馬、羊、雞、鴨等畜禽的糞尿與秸稈墊料堆漚制成的肥料.
沼氣肥：在密封的沼氣池中，有機物腐解產(chǎn)生沼氣后的副產(chǎn)物，包括沼氣液和殘渣。
綠肥：利用栽培或的綠色植物體作肥料。如豆科的綠豆、蠶豆、草木樨、田菁、苜蓿、苕子等。非豆科綠肥有黑麥草、肥田蘿卜、小葵子、滿(mǎn)江紅、水葫蘆、水花生等。
作物秸稈：農作物秸稈是重要的肥料品種之一，作物秸稈含有作物所必需的營(yíng)養元素有N、P、K、 Ca、s等。
在適宜條件下通過(guò)土壤微生物的作用，這些元素經(jīng)過(guò)礦化再回到土壤中，為作物吸收利用。
礦物質(zhì)肥，包括鉀礦粉、磷礦粉、氯化鈣、天然硫酸鉀鎂肥等沒(méi)有經(jīng)過(guò)化學(xué)加工的天然物質(zhì)。此類(lèi)產(chǎn)品要通過(guò)有機認證，并嚴格按照有機標準生產(chǎn)才可用于有機農業(yè)。
餅肥：菜籽餅、棉籽餅、豆餅、芝麻餅、蓖麻餅、茶籽餅等。
泥肥：未經(jīng)污染的河泥、塘泥、溝泥、港泥、湖泥等。