醫院污水處理是指處理醫院排放的污水的處理方式。醫院的污水，除一般生活污水外，還含有化學(xué)物質(zhì)、放射性廢水和病原體。因此，經(jīng)過(guò)處理后才能排放，特別是肝炎等傳染病病房排出來(lái)的污水，須經(jīng)消毒后才可排放。無(wú)集中式污水處理設備的醫院，對有傳染性的糞便，單消毒使其無(wú)害化。常用消毒劑有二氧化氯、漂白粉、液氯、次氯酸鈉、臭氧。對含放射性同位素的污水，應按同位素處理要求處理。醫院污水在處理過(guò)程中，沉淀的污泥含有大量的細菌、病毒和寄生蟲(chóng)卵，須經(jīng)消毒（常用熟石灰消毒）或高溫堆肥后方可用作肥料。

醫院各部門(mén)的功能、設施和人員組成情況不同，產(chǎn)生污水的主要部門(mén)和設施有：診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照像洗印、動(dòng)物房、同位素治療診斷、手術(shù)室等排水。醫院行政管理和醫務(wù)人員排放的生活污水，食堂、單身宿舍、家屬宿舍排水。不同部門(mén)科室產(chǎn)生的污水成分和水量各不相同，如重金屬廢水、含油廢水、洗印廢水、放射性廢水等。而且不同性質(zhì)醫院產(chǎn)生的污水也有很大不同。醫院污水較一般生活污水排放情況復雜。

醫院污水處理過(guò)程中排出的污泥按每張病床計，每天平均為0.7～1升，含水95%，含有污水中病原體總量的70～80%，進(jìn)行消毒處理。消毒方法有加熱消毒、化學(xué)藥劑消毒、γ射線(xiàn)消毒等。加熱消毒的熱源通常為蒸汽、電能或生物能（高溫堆肥），有的地區可以用太陽(yáng)能?；蛘哂梅贌ㄌ幚恚ㄒ?jiàn)污泥焚燒）?；瘜W(xué)藥劑消毒可用漂白粉、石灰、氨水、液氯或苛性鈉等。用漂白粉或液氯時(shí),有效氯用量約為污泥量的2.5%。用堿性藥劑時(shí)，污泥的pH值達到12后，保持半小時(shí)以上，效果好。γ射線(xiàn)消毒可用60鈷或一些裂變產(chǎn)物的混合物作輻射源，輻射劑量為20～30萬(wàn)倫琴。用此法對污泥消毒不產(chǎn)生臭氣，并可改善污泥的脫水和沉降性，但費用較高。

醫用污水處理的原則是：分質(zhì)分流，局部分隔治理，把污染就近消滅在污染源。主要處理方法為沉淀與消毒。我國常用的消毒劑為液氯，近年來(lái)，為了提高消毒效率及不產(chǎn)生二次污染多趨向采用臭氧化法消毒，消毒處理后均可達到排放標準。處理過(guò)程中產(chǎn)生的污泥常采用石灰消毒法及高溫堆肥法進(jìn)行處理。
傳染病醫院的污水和糞便宜分別收集。生活污水直接進(jìn)入預消毒池進(jìn)行消毒處理后進(jìn)入調節池，病人的糞便應先立消毒后，通過(guò)下水道進(jìn)入化糞池或單處理（如虛線(xiàn)所示）。各構筑物須在密閉的環(huán)境中運行，通過(guò)統一的通風(fēng)系統進(jìn)行換氣，廢氣通過(guò)消毒后排放，消毒可采用紫外線(xiàn)消毒系統 好氧生化處理單元去除CODcr、BOD5等有機污染物，好氧生化處理可選擇接觸氧化、活性污泥和好氧處理工藝，如膜生物反應器、曝氣生物濾池等工藝。采用具有過(guò)濾功能的好氧處理工藝，可以降低懸浮物濃度，有利于后續消毒。 適用于傳染病醫院(包括帶傳染病房的綜合醫院)和排入自然水體的綜合醫院處理。
根據國家環(huán)?？偩值挠嘘P(guān)規定（國家環(huán)?？偩?醫院污水處理技術(shù)指南.2003.12（環(huán)發(fā)（2003）197號 ），將各類(lèi)醫院按性質(zhì)分為綜合醫院和傳染病醫院兩類(lèi)，與衛生系統對醫院及醫療機構的劃分方法有差別。其中傳染病醫院指傳染性疾病專(zhuān)科醫院和帶傳染病房的綜合醫院，綜合醫院為不帶傳染病房的綜合醫院和各類(lèi)非傳染性疾病的專(zhuān)科醫院。醫院污水凈化包括綜合醫院、中醫醫院、中西醫結合醫院、民族醫院和專(zhuān)科醫院（傳染病醫院（包括結核病院）、心血管病醫院、腫瘤醫院、口腔醫院、婦產(chǎn)科醫院和精神病醫院等等）各類(lèi)醫院污水的處理，同時(shí)也包括療養院、康復醫院等其它醫療機構和獸醫院的污水處理工程。