化石可以根據其保存特點(diǎn)分為以下幾類(lèi)：
?實(shí)體化石?：如?恐龍骨骼化石。
?模鑄化石?：生物遺體留下的印模。
?遺跡化石?：如?恐龍腳印、?糞便等。
?分子化石?：保存下來(lái)的生物分子。

由于冰河運動(dòng)、地殼變遷等原因，地球生物被迅速埋藏于地下，經(jīng)過(guò)億萬(wàn)年的演變，生物硬體部才被保存下來(lái)。但軀體肉質(zhì)軟組織（包括耳朵、內臟器官）演變?yōu)榛目赡苄晕⒑跗湮?，在自然環(huán)境下很容易被微生物腐蝕溶化，所以很難形成實(shí)體肉化石，因存世量少收藏價(jià)值。學(xué)者黃錦祥發(fā)現的“耳朵”化石，使我們清楚了解到地球上確實(shí)有“肉化石”存在，是人類(lèi)自然科學(xué)史上的一次重大發(fā)現。 [1-2]

煤系地層是生存于古生代時(shí)的植物的化石的主要來(lái)源。煤炭礦是采集化石好的場(chǎng)所，而且碳本身便是化石植物的殘留，雖然植物化石的結構細節很少會(huì )留在碳中。在蘇格蘭格拉斯哥維多利亞公園中的化石森林里，有發(fā)現鱗木的樹(shù)干。


松柏和開(kāi)花植物的根、莖及枝干的化石可以在湖泊及海岸的中生代和新生代地層中被找到。加州紅木、木蘭、櫟樹(shù)和棕櫚樹(shù)等化石常被找到。
石化木普遍存在于世界的部份地區，且常在酸性及沙漠地區中所發(fā)現，因為那些地方很容易因侵蝕作用而暴露。石化木通常都被嚴重地硅化（有機質(zhì)被二氧化硅取代），且生殖組織常會(huì )被保存在良好的狀態(tài)。此類(lèi)的樣本有些會(huì )使用寶石雕琢的裝置來(lái)切割及磨光。石化木的石化林已在每個(gè)大陸中被發(fā)現。


舌羊齒屬等種子蕨的化石廣泛分布在南半球的數個(gè)大陸中，此一事實(shí)支持了阿爾弗雷德·魏格納所提出的大陸漂移學(xué)說(shuō)。

在有文字記載的人類(lèi)歷史的早期，某些希臘學(xué)者曾被在沙漠中及山區有魚(yú)及海生貝殼的存在感到迷惑。公元前450 年希羅多德（Herodotus）注意到埃及沙漠，并正確地認為地中海曾淹沒(méi)過(guò)那一地區。

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