化石作為煉丹材料 煉丹。 唐 駱賓王《代女道士王靈妃贈道士李榮》詩(shī)：“漫道燒丹止七飛，空傳化石曾三轉?！?br/>
《山海經(jīng)》也有“石魚(yú)”（即魚(yú)化石）的記述；南朝齊梁時(shí)期陶弘景有對琥珀中古昆蟲(chóng)的記述；宋朝沈括對螺蚌化石和杜綰對魚(yú)化石的起源，已有了正確認識。迄今，發(fā)現早的細菌化石為距今35億年前的澳大利亞瓦拉翁納群中的絲狀細菌化石。

植物的化石包括根、木、葉、種子、果實(shí)、花粉、孢子、植石和琥珀?；懮现参?br /> 在陸地上、湖泊中、河流里以及近海內的地層都有被發(fā)現到?；ǚ?、孢子和藻類(lèi)（溝鞭藻門(mén)和疑源類(lèi)）被用來(lái)界分地層巖石的順序。殘留的植物化石并不如動(dòng)物化石那么普遍，然而植物化石在世界上許多地區之內，都可以有大量的發(fā)現。

早可以被明確歸類(lèi)于植物界的化石是在寒武紀時(shí)的綠藻化石。這些化石像是絨枝藻目鈣化了的多細胞成員。更早的前寒武紀化石中有發(fā)現像是單細胞綠藻的化石，但依然不確定是何種藻類(lèi)。


有胚植物現知古老的生痕化石源自于奧陶紀，雖然此類(lèi)的化石是零碎不全的。到了志留紀才有完整個(gè)化石被保留下來(lái)，包括石松門(mén)的“刺石松”。泥盆紀之后，萊尼蕨門(mén)的詳細化石在此時(shí)期被發(fā)現，此化石顯示出了其植物組織的單一個(gè)細胞。泥盆紀時(shí)亦出現了被認為是古老樹(shù)木的植物“古羊齒屬”，此類(lèi)植物在其樹(shù)干上有蕨葉，但此蕨葉不會(huì )產(chǎn)生孢子。


煤系地層是生存于古生代時(shí)的植物的化石的主要來(lái)源。煤炭礦是采集化石好的場(chǎng)所，而且碳本身便是化石植物的殘留，雖然植物化石的結構細節很少會(huì )留在碳中。在蘇格蘭格拉斯哥維多利亞公園中的化石森林里，有發(fā)現鱗木的樹(shù)干。

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