由于冰河運動(dòng)、地殼變遷等原因，地球生物被迅速埋藏于地下，經(jīng)過(guò)億萬(wàn)年的演變，生物硬體部才被保存下來(lái)。但軀體肉質(zhì)軟組織（包括耳朵、內臟器官）演變?yōu)榛目赡苄晕⒑跗湮?，在自然環(huán)境下很容易被微生物腐蝕溶化，所以很難形成實(shí)體肉化石，因存世量少收藏價(jià)值。學(xué)者黃錦祥發(fā)現的“耳朵”化石，使我們清楚了解到地球上確實(shí)有“肉化石”存在，是人類(lèi)自然科學(xué)史上的一次重大發(fā)現。 [1-2]

保存于地層中的古生物遺體、遺物或遺跡，埋藏在地下，經(jīng)過(guò)自然界的作用，變化而成的保留原物體、遺跡形狀、結構或印模的鈣化、碳化、硅化、礦化的東西。研究化石可了解生物的發(fā)展情況，并能據以確定地層的年代。艾青《魚(yú)化石》詩(shī)：“凝視著(zhù)一片化石，傻瓜也得到教訓：離開(kāi)了運動(dòng)，就沒(méi)有生命。

早可以被明確歸類(lèi)于植物界的化石是在寒武紀時(shí)的綠藻化石。這些化石像是絨枝藻目鈣化了的多細胞成員。更早的前寒武紀化石中有發(fā)現像是單細胞綠藻的化石，但依然不確定是何種藻類(lèi)。


有胚植物現知古老的生痕化石源自于奧陶紀，雖然此類(lèi)的化石是零碎不全的。到了志留紀才有完整個(gè)化石被保留下來(lái)，包括石松門(mén)的“刺石松”。泥盆紀之后，萊尼蕨門(mén)的詳細化石在此時(shí)期被發(fā)現，此化石顯示出了其植物組織的單一個(gè)細胞。泥盆紀時(shí)亦出現了被認為是古老樹(shù)木的植物“古羊齒屬”，此類(lèi)植物在其樹(shù)干上有蕨葉，但此蕨葉不會(huì )產(chǎn)生孢子。


舌羊齒屬等種子蕨的化石廣泛分布在南半球的數個(gè)大陸中，此一事實(shí)支持了阿爾弗雷德·魏格納所提出的大陸漂移學(xué)說(shuō)。

在有文字記載的人類(lèi)歷史的早期，某些希臘學(xué)者曾被在沙漠中及山區有魚(yú)及海生貝殼的存在感到迷惑。公元前450 年希羅多德（Herodotus）注意到埃及沙漠，并正確地認為地中海曾淹沒(méi)過(guò)那一地區。

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