《山海經(jīng)》也有“石魚(yú)”（即魚(yú)化石）的記述；南朝齊梁時(shí)期陶弘景有對琥珀中古昆蟲(chóng)的記述；宋朝沈括對螺蚌化石和杜綰對魚(yú)化石的起源，已有了正確認識。迄今，發(fā)現早的細菌化石為距今35億年前的澳大利亞瓦拉翁納群中的絲狀細菌化石。

簡(jiǎn)單地說(shuō)，化石就是生活在遙遠的過(guò)去的生物的遺體或遺跡變成的"石頭"。許多都被當時(shí)的泥沙掩埋起來(lái)。在隨后的歲月中，這些生物遺體中的有機物質(zhì)分解殆盡；同樣，那些生物生活時(shí)留下的痕跡也可以這樣保留下來(lái)。我們把這些石化的生物遺體、遺跡就稱(chēng)為化石。從化石中可以看到古代動(dòng)物、植物的樣子，從而可以推斷出古代動(dòng)物、植物的生活情況和生活環(huán)境，可以推斷出埋藏化石的地層形成的年代和經(jīng)歷的變化，可以看到生物從古到今的變化等等。因為在較老的巖石中的化石通常是原始的較簡(jiǎn)單的，而在年代較新的巖石中的類(lèi)似種屬的化石就要復雜和。

松柏和開(kāi)花植物的根、莖及枝干的化石可以在湖泊及海岸的中生代和新生代地層中被找到。加州紅木、木蘭、櫟樹(shù)和棕櫚樹(shù)等化石常被找到。
石化木普遍存在于世界的部份地區，且常在酸性及沙漠地區中所發(fā)現，因為那些地方很容易因侵蝕作用而暴露。石化木通常都被嚴重地硅化（有機質(zhì)被二氧化硅取代），且生殖組織常會(huì )被保存在良好的狀態(tài)。此類(lèi)的樣本有些會(huì )使用寶石雕琢的裝置來(lái)切割及磨光。石化木的石化林已在每個(gè)大陸中被發(fā)現。

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