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雖然有機肥的成分種類(lèi)較多，但是每種養分的含量相對較少，并且病菌較多。需要存放腐熟以殺滅病菌、并與化學(xué)肥料配合使用，效果更好。
隨著(zhù)科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展，通過(guò)有益菌群的人工篩選、分離、馴化培養技術(shù)，將有益菌群接入無(wú)害化處理后有機肥中，可以生產(chǎn)出多種多樣不同品種的生物有機肥，它能改善土質(zhì)、減少環(huán)境污染、增肥增效等。
有機農業(yè)中使用的有機肥需經(jīng)過(guò)有機認證機構的認證，符合產(chǎn)品的生產(chǎn)標準。近些年來(lái)，我國各種生物肥料發(fā)展迅速，年產(chǎn)量達數十萬(wàn)噸以上。這些生物肥料以科技含量較高、增產(chǎn)效果明顯和為主要特點(diǎn)，它的生產(chǎn)、推廣和應用對增進(jìn)土壤肥力，提高農作物產(chǎn)量，改善農作物品質(zhì)和切實(shí)推行農業(yè)可持續發(fā)展都有積極意義。 針對生物肥料在生產(chǎn)、產(chǎn)品質(zhì)量和使用等方面存在的問(wèn)題，本刊記者采訪(fǎng)了江西農業(yè)大學(xué)高勇生教授，旨在提高農村廣大群眾對這類(lèi)肥料的認識，更加正確、科學(xué)地使用這些肥料，以促進(jìn)我國生物肥料的健康發(fā)展。

生物有機肥是指特定功用微生物與主要以動(dòng)植物殘體(如畜禽糞便、農作物秸稈等)為來(lái)歷并經(jīng)無(wú)害化處理、腐熟的有機物料復合而成的一類(lèi)兼具微生物肥料和有機肥效應的肥料。和化肥比較，生物有機肥營(yíng)養元素完全，具有改善土壤、進(jìn)步產(chǎn)品品質(zhì)、改善作物根際微生物群、進(jìn)步植物的抗病蟲(chóng)才能、進(jìn)步化肥使用率等特色，深受農喜歡?？墒?，在近年來(lái)生物有機肥出產(chǎn)經(jīng)銷(xiāo)和實(shí)踐使用中，卻呈現了一系列亟待解決的問(wèn)題，詳細如下：

主要來(lái)源于植物和（或）動(dòng)物，施于土壤以提供植物營(yíng)養為其主要功能的含碳物料。經(jīng)生物物質(zhì)、動(dòng)植物廢棄物、植物殘體加工而來(lái)，消除了其中的有毒有害物質(zhì)，富含大量有益物質(zhì)，包括：多種有機酸、肽類(lèi)以及包括氮、磷、鉀在內的豐富的營(yíng)養元素。不僅能為農作物提供全面營(yíng)養，而且肥效長(cháng)，可增加和更新土壤有機質(zhì)，促進(jìn)微生物繁殖，改善土壤的理化性質(zhì)和生物活性，是綠色食品生產(chǎn)的主要養分廣義
俗稱(chēng)農家肥，包括以各種動(dòng)物、植物殘體或代謝物組成，如人畜糞便、秸稈、動(dòng)物殘體、屠宰場(chǎng)廢棄物等。
另外還包括餅肥（菜籽餅、棉籽餅、豆餅、芝麻餅、蓖麻餅、茶籽餅等）；堆肥；漚肥；廄肥；沼肥；綠肥等。
主要是以供應有機物質(zhì)為手段，借此來(lái)改善土壤理化性能，促進(jìn)植物生長(cháng)及土壤生態(tài)系統的循環(huán)。