冷藏集裝箱有外置式冷藏集裝箱與內藏式冷藏集裝箱兩種。外置式冷藏集裝箱沒(méi)有冷凍設備，只有隔熱結構，即在集裝箱前壁設 有冷氣吸入口和排氣口，箱子裝在艙內，由船舶的冷氣袋供應冷氣。冷氣從底面吹到上面，使內部溫度保持不變，長(cháng)時(shí)間航行時(shí), 比內藏式發(fā)生故障少。此箱適合于海上運輸，氣溫在40°C時(shí)，箱內仍可保持零下25°C。由于未安裝冷機，箱內容積較大，自重也 減輕，可以多裝貨物。此集裝箱的缺點(diǎn)：由于船舶裝冷氣機，要增加投資；因艙內安裝了套管而減少艙容；集裝箱在陸地上保管困難。

冷藏集裝箱廣泛采用機械式制冷裝置，分為制冷式和冷藏式兩種。冷凍式冷藏集裝箱箱內溫度在-18℃以下，用于運輸冷凍食品，如豬肉、牛肉、魚(yú)和家禽。冷藏式冷藏集裝箱箱內的溫度一般為5℃~16℃，適合水果、蔬菜、花木等運輸。國際間通用的冷藏集裝箱一般是冷凍冷藏箱。冷凍裝置和加熱裝置可以根據使用要求任意調節箱內溫度，可以運輸冷凍食品，可以運輸冷卻食品或其他貨物。

在二手冷藏集裝箱制冷裝置運行過(guò)程中，蒸發(fā)器盤(pán)管上會(huì )形成冰層，這取決于設定溫度、貨物溫度、通風(fēng)裝置的新風(fēng)量和貨物濕度。制冷裝置會(huì )定期進(jìn)入除霜狀態(tài)，一系列電加熱裝置會(huì )產(chǎn)生熱量或向蒸發(fā)器盤(pán)管內吹入熱空氣。此時(shí)所有風(fēng)扇將停止旋轉，以防止熱空氣進(jìn)入貨艙。但是，由于回風(fēng)溫度傳感器位于制冷機組附近，因此可能會(huì )記錄溫度升高。因此，除非經(jīng)過(guò)數據記錄軟件處理，否則溫度記錄會(huì )顯示與除霜間隔一致的周期性溫升。如果除霜時(shí)間很短，每小時(shí)的溫度讀數和除霜時(shí)間可能會(huì )有一些差異。